Закрыт храм Богоявления Господня на Гутуевском острове

5 мая н. ст. 1935 года постановлением ВЦИК. с указанием использовать впредь под архиуправление, храм Богоявления был закрыт. В конце 1930-х годов он использовался уже как склад продовольствия, в блокаду здесь размещался морг. Во время одного из налетов немецкой авиации произошло прямое попадание снаряда в храм, внутри здания возник пожар» в результате которого храм сгорел. Снаружи все здание покрылось черной копотью, а интерьер погиб почти полностью в огне пожара.

После войны храм долгое время пустовал, затем вновь стал использоваться под склад, для чего в 1960-х годах был произведен ремонт: над барабаном был установлен новый купол, по формам отдаленно напоминающий прежний, поновлена кровля. В 1970—71 гг. в церкви планировалось произвести реставрационные работы, однако далее составления проекта реставрации дело не двинулось. С этого времени по сентябрь 1991 года в храме размещался склад Фрунзенского универмага.