Заложен 10 июня 1803 по проекту арх. Дж. Кваренги и его помощника арх. Белкина, освящен 15 июля 1805. «Мариинская больница для бедных учреждена христианским сердоболием Императрицы Марии Феодоровны в 1803. Блажени милостивии, яко тии помиловани будут. Матф. 5,7», – написано было на мраморной доске, висевшей в больничном храме.
В 1918 храм закрыт, в 1923 переоборудован под зал заседаний. Богослужения возобновлены на Рождество 2000. В настоящее время в связи с капитальным ремонтом главного корпуса больницы и находящегося в нем храма службы совершаются в переоборудованной под молитвенную комнату учебной аудитории. При больнице действует Покровская община, сестры которой безвозмездно осуществляют диаконическое служение и проводят катехизаторские беседы в «Православной гостиной».