Построен в 1911 как памятник всем павшим за Отечество русским морякам, как «символ братской могилы для погибших без погребения героев-моряков» в русско-японской войне 1904–1905 (арх. М. М. Перетяткович). Внутри на стенах были укреплены бронзовые доски с именами всех погибших моряков – 12 тысяч имен, от адмирала Макарова до последнего кочегара. 10 августа 1911 протопр. Г. И. Шавельский в присутствии родственников погибших освятил нижний храм, а через три дня – верхний, в присутствии Государя с дочерьми, вел. кн. Константина Константиновича и других членов Императорской семьи. В 1919 храм стал приходским, а в начале 1932 – закрыт и вскоре взорван.
Сейчас на месте храма стоит корпус ГП «Адмиралтейские верфи». В 1991 началось движение за
восстановление храма. Ведутся изыскательские работы.